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该子系统能够覆盖省、市、县、乡级疾控机构和医疗机构用户使用，以由食品或疑似由食品引起的感染病例、中毒病例和异常病例等食源性疾病病例或疑似食源性疾病病例为核心，通过对散发个案病例信息的采集、汇总和分析，为发现食品安全隐患提供技术支持。其主要功能包括数据导入、数据填报、实验室确诊病例调查、医院每月汇总、数据审核、数据管理、聚集性病例、数据统计、关联性分析、风险评估、数据大屏、监测预警、系统管理等功能。
关联性分析功能能够基于关联食品安全病例暴发事件，着眼于从全省散发病例信息实时数据中自动利用大数据分析挖掘思想和相关技术，通过聚集性事件多维要素关联设置及后台自动分析，实现可疑暴发事件分析识别发现及详细病例按需调阅，满足预警和流调工作开展需要。