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北京中科助腾科技有限公司

BN分析软件、食品微生物溯源分析、食品安全风险监测、食品消费...

网站公告
诚邀全国各省卫健委或疾控业务的代理,提供食品安全、营养健康、学校卫生、微生物等软件或大平台。
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中科助腾微生物数据分析平台
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产品: 浏览次数:98中科助腾微生物数据分析平台 
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最后更新: 2022-03-16 16:12
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GenesClouds微生物数据分析平台

   
GenesClouds微生物全基因组数据存储分析平台实现微生物全基因组数据的有序存储,提升实验室数据管理水平;提供“一键式”的生物信息学分析能力。

微生物全基因组数据存储分析平台”解决了高通量全基因组数据的安全存储、快速计算、精准比对和可视化展示等难题,形成了全基因组数据快速综合分析及组网溯源预警能力,能够为我国传染病防治、食品安全事故处置和精准溯源预警等提供坚实技术支撑。

 

适用场景
疾控中心、海关检疫、市场监管机构、农业系统、高校科研、医疗健康、食品企业、药品企业、第三方检验检测。

  平台WGS分析功能
  
质控(fastqc/quast/Trimmomatic/fastp)

拼接分析(Spades/Velvet/Unicycler/canu)

特征基因分析(Virulence/Resistance/Serotype)

基因组注释(Prokka)

菌种鉴定(Kraken2)

分子分型(cgMLST/wgMLST/wgSNP)

聚类分析(Dendrogram/MInimum Spanning Tree)
 

目前向用户提供以下菌种的wgMLST/cgMLST分析:

Acinetobacter baumannii

Brucella melitensis

Campylobacter jejuni/coli

Clostridioides difficile

Enterococcus faecalis

Enterococcus faecium

Escherichia coli

Francisella tularensis

Klebsiella pneumoniae/variicola/quasipneumoniae

Legionella pneumophila

Listeria monocytogenes

Mycobacterium tuberculosis/bovis/africanum/canettii

Mycoplasma gallisepticum

Paenibacillus larvae

Pseudomonas aeruginosa

Salmonella enterica

Staphylococcus aureus


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